外显子组测序（Exome sequencing）
全外显子组（ Exome）是指基因组中全部外显子区域的总和，人类的外显子组约占基因组的 1%~2%，包含了蛋白质合成的重要信息，是基因行使功能最直接的体现。
长链非编码RNA测序（lncRNA-seq）
长链非编码RNAs（long non-coding RNAs，lncRNAs）是一类长度大于200 nt且不编码蛋白质的RNAs（不含rRNA）
circRNA 测序
circRNA 是一类区别于传统线性RNA的非编码RNA分子，呈闭合环状结构，对RNase R不敏感，比线性RNA更加稳定。使用二代测序技术对其进行测序。
真核mRNA测序
真核mRNA转录组测序是借助新一代高通量测序技术，以真核细胞在某一功能状态下所能转录出的全部mRNA为研究对象，全面了解该生物样品在特定时空下基因的表达情况。